Bài giảng Chương 21: Các hệ gen và sự tiến hóa của chúng
21.1. Các phương pháp mới đ giúp gia tăng tốc độ giải trình tự các hệ gen
21.2. Các nhà khoa học ứng dụng tin sinh học để phân tích các hệ gen và chức năng của chúng
21.3. Các hệ gen khác nhau về kích cỡ, số gen và mật độ gen
21.4. Sinh vật nhân thật đa bào có nhiều ADN không m hóa và nhiều họ đa gen
21.5. Lặp đoạn, tái sắp xếp và đột biến trong trình tự ADN đóng góp vào quá trình tiến hóa
21.6. So sánh các trình tự hệ gen cung cấp bằng chứng về các quá trình tiến hóa và phát triển
sinh vật nhân thật đa bào là các yếu tố di truyền vận động và các trình tự có liên quan đến chúng. Có hai loại yếu tố vận động trong hệ gen sinh vật nhân thật: transposon vận động thông qua một phân tử ADN trung gian, và retrotransposon có mức độ phổ biến cao hơn và vận động thông qua một phân tử ARN trung gian. Các trình tự ADN lặp lại khác, bao gồm cả các ADN trình tự đơn giản. Nhiều trình tự ngắn không mã hóa lặp lại liên tục hàng nghìn lần (gọi là các ADN trình tự đơn giản, bao gồm cả các STR) có mặt đặc biệt phổ biến ở vùng tâm động và các đầu mút nhiễm sắc thể; chúng có thể có vai trò quan trọng trong cấu trúc của nhiễm sắc thể. Các gen và các họ đa gen. Mặc dù nhiều gen ở sinh vật nhân thật chỉ có một bản sao duy nhất trong bộ nhiễm sắc thể đơn bội của chúng, các gen còn lại (phần lớn ở một số loài) là thành viên của cùng họ các gen có quan hệ với nhau. Đơn vị phiên mã t−ơng ứng với ba loại rARN lớn nhất lặp lại liên tiếp hàng trăm nghìn lần trên một hoặc một số vị trí khác nhau của các nhiễm sắc thể; cấu trúc này giúp tế bào có thể nhanh chóng tổng hợp rARN cần Khái niệm 21.3 Khái niệm 21.4 Lặp đoạn, tái sắp xếp và đột biến trong trình tự ADN đóng góp vào quá trình tiến hóa (các trang 438 – 442) Sự nhân đôi các bộ nhiễm sắc thể. Các sự kiện ngẫu nhiên trong quá trình phân bào có thể dẫn đến các tế bào có thêm những bản sao của tất cả hay một phần hệ gen. Những hệ gen này sau đó có thể phân ly nếu nh− một bộ nhiễm sắc thể tích lũy các biến đổi trong trình tự ADN. Sự thay đổi cấu trúc nhiễm sắc thể. Cấu trúc nhiễm sắc thể các hệ gen có thể đ−ợc đem so sánh giữa các loài, qua đó cung cấp thông tin về mối quan hệ tiến hóa. Trong phạm vi một loài nhất định, sự sắp xếp lại các nhiễm sắc thể đ−ợc cho là một cơ chế đóng góp vào sự phát sinh loài mới. Lặp đoạn và sự phân ly của các vùng ADN có kích th−ớc t−ơng ứng với gen. Các gen mã hóa cho các loại protein globin khác nhau tiến hóa bắt nguồn từ một gen globin tổ tiên chung; gen tổ tiên này đã nhân đôi và phân ly thành các gen tổ tiên của α-globin và β-globin. Hiện t−ợng nhân đôi sau đó kết hợp với các đột biến ngẫu nhiên đã dẫn đến sự hình thành các gen hiện nay; tất cả những gen này đều mã hóa cho các protein liên kết ôxy. Các bản sao khác nhau của gen lặp đã phân ly đến mức mà chức năng của các protein hiện nay do chúng mã hóa đã trở nên khác nhau một cách căn bản. Sự sắp xếp lại các phần của gen: lặp đoạn và trao đổi exon. Sự sắp xếp lại các exon trong phạm vi một gen và giữa các gen trong quá trình tiến hóa đã dẫn đến các gen chứa nhiều bản sao của các exon giống nhau và/hoặc của một số exon khác nhau bắt nguồn từ các gen khác. Các yếu tố vận động góp phần vào sự tiến hóa của hệ gen nh− thế nào ? Sự di chuyển của các yếu tố vận động hay tái tổ hợp giữa các bản sao của cùng một yếu tố vận động đôi khi tạo ra những tổ hợp trình tự mới có lợi cho cơ thể sinh vật. Những cơ chế nh− vậy có thể làm thay đổi các chức năng của các gen hoặc kiểu biểu hiện hay điều hòa biểu hiện của chúng. Phòng thí nghiệm (PTN) sinh học trực tuyến PTN Hemoglobin So sánh các trình tự hệ gen cung cấp bằng chứng về các quá trình tiến hóa và phát triển So sánh các hệ gen Các nghiên cứu so sánh hệ gen giữa các loài có quan hệ gần gũi cũng nh− giữa các loài có mức độ phân ly xa hơn cung cấp nhiều thông tin giá trị t−ơng ứng về lịch sử tiến hóa cận đại và cổ x−a. Các trình tự hệ gen ng−ời và tinh tinh khác nhau khoảng 4%, chủ yếu do thêm đoạn, mất đoạn, và lặp đoạn trong một nhánh tiến hóa. Cùng với các biến đổi về các nucleotit trong những gen đặc thù (ví dụ nh− gen FOXP2, một gen ảnh h−ởng đến khả năng phát âm), những thay đổi này có thể giải thích cho các đặc điểm khác biệt giữa hai loài. Các đa hình đơn nucleotit giữa các cá thể trong phạm vi một loài cũng có thể cung cấp thông tin về lịch sử tiến hóa của loài đó. So sánh quá trình phát triển Các gen điều khiển phát triển và một số gen khác có liên quan đến quá trình phát triển ở động vật chứa một vùng homeobox; đó là trình tự giống hệt nhau hoặc rất giống nhau ở nhiều loài. Nhiều trình tự có quan hệ với nhau đ−ợc tìm thấy đồng thời ở các hệ gen cthực vật và nấm men. Các gen điều hòa phát triển khác cũng có tính bảo thủ cao ở các loài động vật, nh−ng chúng có thể có vai trò khác nhau trong quá trình phát triển của các loài khác nhau. Trong quá trình phát triển phôi ở động vật cũng nh− thực vật có một chuỗi các yếu tố phiên mã giúp bật hoặc tắt các gen theo một trật tự nghiêm ngặt. Tuy vậy, các gen điều khiển quá trình phát triển t−ơng tự lại có trình tự khác nhau đáng kể khi so sánh giữa động vật và thực vật; có lẽ do tổ tiên của chúng đã phân ly từ lâu trong quá trình tiến hóa. Khái niệm 21.5 Đa ph−ơng tiện Khái niệm 21.6 Ch−ơng 21 Các hệ gen và sự tiến hóa của chúng 449 chuột và ng−ời. Đây chính là những phân đoạn chứa tất cả các axit amin khác nhau trong protein FOXP2 khi so sánh giữa những loài này. 1. ATETI PKSSD TSSTT NARRD 2. ATETI PKSSE TSSTT NARRD 3. ATETI PKSSD TSSTT NARRD 4. ATETI PKSSD TSSNT SARRD 5. ATETI PKSSD TSSTT NARRD 6. VTETI PKSSD TSSTT NARRD Hãy dùng bút đánh dấu bôi màu vào các axit amin khác biệt giữa các loài. (phủ màu lên axit amin đó ở tất cả các loài.) Sau đó, trả lời các câu hỏi d−ới đây: a. Các trình tự của tinh tinh (T), khỉ gorila (G) và khỉ rêzut (R) giống hệt nhau. Những dòng nào t−ơng ứng với những loài này. b. Trình tự ở ng−ời khác với trình tự của các loài T, G và R ở hai axit amin. Dòng nào t−ơng ứng với trình tự của ng−ời? Gạch chân hai axit amin khác biệt. c. Trình tự của đ−ời −ơi khác với trình tự của các loài T, G và R ở một axit amin (thay thế alanine bằng valine) và khác với trình tự của ng−ời ở ba axit amin. Dòng nào t−ơng ứng với trình tự của đ−ời −ơi ? d. Có bao nhiêu axit amin khác biệt giữa trình tự của chuột so với trình tự của các loài T, G và R? Khoanh tròn vào các axit amin khác biệt ở chuột. Có bao nhiêu axit amin khác biệt giữa chuột và ng−ời? Vẽ hình vuông bao quanh axit amin khác biệt ở chuột. e. Các loài linh tr−ởng và bộ gặm nhấm phân ly khỏi nhau cách đây khoảng từ 60 đến 100 triệu năm, còn ng−ời và tinh tinh phân ly khỏi nhau cách đây khoảng 6 triệu năm. Từ cơ sở đó, bạn có thể kết luận điều gì khi so sánh sự khác biệt về trình tự axit amin giữa chuột với các loài T, G và R đồng thời đối chiếu với sự khác biệt giữa ng−ời với các loài T, G và R? Xem gợi ý trả lời Các câu hỏi tự đánh giá ở Phụ lục A. Thực hiện bài Kiểm tra thực hành tại trang web www.masteringbio.com liên hệ với tiến hóa 8. Các gen giữ vai trò quan trọng trong phát triển phôi ở động vật, chẳng hạn nh− các gen mang miền homeobox, có tính bảo thủ t−ơng đối cao trong quá trình tiến hóa; nghĩa là, khi so sánh giữa các loài, chúng giống nhau nhiều hơn so với nhiều gen khác. Tại sao lại nh− vậy? Tìm hiểu khoa học 9. Các nhà khoa học khi lập bản đồ các SNP trong hệ gen ng−ời đã để ý thấy hiện t−ợng các nhóm SNP có xu h−ớng di truyền với nhau thành từng khối và đ−ợc gọi là các đơn dạng (hoặc đơn nhánh; haplotype) có chiều dài từ 5000 đến 200.000 cặp bazơ. Mỗi haplotype chỉ có khoảng từ 4 đến 5 kiểu tổ hợp của các SNP xuất hiện phổ biến. Hãy nêu giả thiết giải thích cho hiện t−ợng này trên cơ sở kết hợp các thông tin thu nhận đ−ợc từ ch−ơng này nói riêng và khối kiến thức di truyền học nói chung. Đa ph−ơng tiện Các câu hỏi tự đánh giá 1. Tin sinh học bao gồm tất cả các nội dung sau, trừ a. sử dụng các ch−ơng trình máy tính để so sánh các trình tự ADN. b. phân tích t−ơng tác giữa các protein trong một loài. c. sử dụng sinh học phân tử để kết hợp ADN từ các nguồn khác nhau trong điều kiện in-vitro. d. phát triển các công cụ máy tính để phân tích hệ gen. e. sử dụng các công cụ toán học để tìm hiểu các hệ thống sinh học. 2. Loài nào d−ới đây có hệ gen lớn nhất và mật độ gen thấp nhất tính theo số cặp bazơ có trong hệ gen ? a. Haemophilus influenza (vi khuẩn) b. Saccharomyces cerevisiae (nấm men) c. Arabidopsis thaliana (thực vật) d. Drosophila melanogaster (ruồi giấm) e. Homo sapiens (ng−ời hiện đại) 3. Một đặc điểm của các retrotransposon là a. chúng mã hóa cho một enzym tổng hợp ADN sử dụng ARN làm mạch khuôn. b. chúng chỉ đ−ợc tìm thấy ở các tế bào động vật. c. chúng th−ờng vận động bởi cơ chế cắt - dán. d. chúng đóng góp một phần đáng kể vào các biến dị di truyền quan sát thấy trong một quần thể các giao tử. e. chúng đ−ợc nhân bản phụ thuộc vào một retrovirut. 4. Các họ đa gen là a. các nhóm trình tự tăng c−ờng điều khiển phiên mã. b. các gen th−ờng kết thành cụm ở các đầu mút. c. các cấu trúc t−ơng ứng với các operon của sinh vật nhân sơ. d. các nhóm gen đ−ợc điều khiển đồng thời. e. các bộ gen giống hệt nhau hoặc rất giống nhau tiến hóa qua quá trình lặp gen. 5. Hai protein ở sinh vật nhân thật chứa một miền chức năng giống nhau, song phần còn lại của chúng thì rất khác nhau. Quá trình nào d−ới đây nhiều khả năng góp phần gây ra sự giống nhau này của chúng ? a. Lặp gen d. Biến đổi histone b. Xén ARN e. Các đột biến điểm ngẫu nhiên c. Trao đổi exon 6. Các gen điều khiển phát triển (homeotic genes) a. mã hóa cho các yếu tố phiên mã điều khiển sự biểu hiện của các gen có vai trò xác định cấu trúc giải phẫu đặc thù. b. chỉ đ−ợc tìm thấy ở Drosophila và các loài thân đốt. c. là những gen duy nhất mang miền homeobox. d. mã hóa cho các protein hình thành nên cấu trúc giải phẫu của ruồi giấm. e. có vai trò xác định mẫu hình phát triển của thực vật. 7. ở phía trên của cột bên là các trình tự axit amin (dùng kiểu viết tắt một chữ cái; xem Hình 5.17) thuộc bốn phân đoạn ngắn của protein FOXP2 đ−ợc tìm thấy ở 6 loài khác nhau, gồm: tinh tinh, đ−ời −ơi, khỉ gorila, khỉ rêzut, Kiểm tra kiến thức của bạn vẽ tiếp
File đính kèm:
- Campbell_Ch21_HeGen&TienHoa.pdf