Đề tài Tin Sinh học: Tìm hiểu vể gen kiểm soát sự ra hoa

TAACAGAACATTTAATCTGTTCCAGAGAAAAAGCGACAAAGCGAACCCGTTTTAATTATTAAATATTTTGTAGTTTACTCCTTATAATTAAGTGGTTGAGTCGGGCATGTGAGTTTTCGCAGGTGACAAATCAGGTGTTTAGGTTTGCAAAGAAGGCTGGGGCAAGCTATATTAACAAGCCAAAAATGAGACACTATGTGCATTGCTATGCGTTGCATTGCCTGGACGAGGAAGCATCAGATGCACTGAGGAGGGTTTTCAAGGAAAGAGGAGAGAACGTGGGGGCTTGGCGACAGGCTTGCTATAAGCCACTTGTGGGCATAGCAGCACGGCAAGGTTGGGATATTGATGCCATTTTCAATGCGCATCCTCGTCTGGCCATTTGGTATGTGCCCACTAGGCTGCGTCAACTCTGTCATGCCGAGCGCAATGGTGCTGCTGCTTCTAGCTCTGTTTCTGCCGAGGCTGATCAGCTGCCTTTCTAAATTAAATTAAAGCCGGACTGAAGAGAGAAAATTTAGTTAATGGTATTTACAGTGTCTGTTATTACAGTGTTGATTCGTCAATGTTTGTAATCTCACTTCATTTGGACGGATTÌM KHUNG ĐỌC MỞ ORF CỦA GEN ORF BẰNG NCBITÌM KHUNG ĐỌC MỞ ORF CỦA GEN LFY BẰNG PHẦN MỀM DNA CLUBVị trí của khung đọc mởSO SÁNH TƯƠNG ĐỒNG VÀ TẠO CÂY PHÁT SINH LOÀI CỦA GEN LFY Ở MỘT VÀI GIỐNG XOÀI BẰNG PHẦN MỀM CLUSTALX2 VÀ TREEVIEW XNhững vị trí giống nhau được tô màu giống nhauSO SÁNH TƯƠNG ĐỒNG VÀ TẠO CÂY PHÁT SINH LOÀI CỦA GEN LFY Ở MỘT VÀI GIỐNG XOÀI BẰNG PHẦN MỀM CLUSTALX2 VÀ TREEVIEW XKiểu hình của sự ra hoa được thúc giục trong sự đột biến mất chức năng (loss-of-function mutants) cho thấy rằng một số gene giữ vai trò ức chế sự ra hoa ở cây hoang dại. 	Gene EMF1 (EMBRYONIC FLOWER) được xem là có vai trò chính trong sự ức chế sự ra hoa vì sự đột biến emf1 ra hoa mà trước đó không qua giai đoạn sinh trưởng dinh dưỡng. Trong sự đột biến emf1 cấu trúc các cơ quan sinh sản như núm nhụy và cấu trúc như bầu noãn xuất hiện trên tử diệp và chồi sản xuất lá không có dạng hoa hồng (Sung và ctv., 1992; Castle và Sung, 1995). Gene EMF được xem là giữ vai trò chính trong việc ức chế sự ra hoa và chức năng nầy giảm cùng với sự phát triển của cây. Khi mà mức độ EMF giảm đến một mức độ nào đó, mô phân sinh chồi ngọn phân hóa thành mô phân sinh hoa và quá trình khởi phát hoa. Trong một số trường hợp đột biến kép (như emf/co và emf/gi) kiểu hình của đột biến emf không thể phục hồi lại. Điều nầy cho thấy rằng chức năng của những gene nầy là ngăn cản sự hoạt động của emf trong trường hợp bình thường. Thời gian ra hoa kéo dài trong sự đột biến co và gi do kết quả từ sự thúc đẩy của gene EMF(Martinez-Zapater và ctv., 1994; Weigel và Nilsson, 1995). Phân tích sự đột biến EMF cho thấy sự sinh trưởng sinh sản là tình trạng căn bản trong sự phát triển của cây và sự phát triển sau đó là một quá trình làm giảm sự ức chế.	TFL1 (TERMINAL FLOWER) là một gene ức chế sinh trưởng khác được tạo dòng. Đột biến tfl1 ra hoa sớm hơn và ảnh hưởng không giới hạn thông thường kết thúc với một hoa. Chức năng của TFL1 là ức chế sự hình thành hoa ở mô phân sinh chồi ngọn. Trong cây chuyển gene với 35S::TFL1, vị trí của hoa được thay thế bởi một giai đoạn tăng trưởng phát hoa mới trên cây Arabidopsis. Điều nầy cho thấy rằng gene TFL1 được sao chép ở mức độ thấp trong các vị trí nầy. Sự thể hiện quá mức của gene TFL1 ức chế sự phân hóa đến mức cây tiếp tục sinh trưởng dinh dưỡng. Nghiên cứu sự đột biến kép cho thấy gene TFL1 gây ra sự chậm trễ trong sự ra hoa bằng cách ức chế chức năng của một số gene họat động theo cơ chế tự lập như FCA, FVE và FPA. Gene TFL1 được thể hiện trong nhiều lớp tế bào bên dưới mô phân sinh chồi ngọn của cây arabidopsis nên TFL1 được bao gồm trong sự truyền tính trạng của những tín hiệu tạo ra bởi chất ức chế chương trình ra hoa ở mô phân sinh ngọn (Pidkowich và ctv., 1999).>gi|145357903|ref|NM_121191.3| Arabidopsis thaliana embryonic flower 1 (EMF1) (EMF1) mRNA, complete cdsTTTCAAGGATAAGAGAGCTCCACTTTCTCTCTCCTCTCCTTTCTCCAACAGTCTCTCTCTACAAGCCATAGGAAAAAAAAAAAAGTCCCCCTTTCTCTCTCCCTCCCCTTTCGTCTTAGGGTTTCTCGAAAATTCGCAGTCAAATTCTACTCATCTCCCGACGAATCCATCCTTCAAGCTCATCTAATCTTCTTCTCCGTAGCTTTCTCAATCTACCGATATAGTTTTTATCCCTTGCCGCTTAAGATCGAGCTCGAATCTCGCAACCCCTTTTAATCCCTAATTTCTGGTCGGATTAACCCAGCTCTAGTTGCGGAGAGAGTATAATGGTGTATGAAAGTTAATCATCACTGAGGCATAGTATCTATCTCCTTCAAGCAAATCAATGGGATCTTCCATCAAGATCAACTCAATATCCATAGATCTCGCAGGTGCTGCCAACGAGATTGATATGGTGAAATGTGATCATTTTTCCATGCGTGGATTCGTAGCTGAAACTCGTGAGAGAGACCTTAGAAAATGTTGGCCGTTTTCAGAAGAGAGTGTTAGTTTAGTAGACCAACAAAGCTATACTCTTCCTACTTTATCTGTTCCAAAGTTTAGATGGTGGCATTGTATGAGCTGCATCAAAGATATAGATGCTCATGGGCCAAAAGATTGTGGACTGCATTCAAACTCAAAAGCTATTGGAAACTCTTCTGTTATCGAAAGTAAAAGCAAGTTCAATTCGCTAACTATCATTGATCACGAGAAAGAAAAGAAAACTGATATTGCAGATAATGCTATTGAGGAGAAAGTGGGTGTAAACTGTGAGAATGATGATCAGACAGCTACTACGTTTCTCAAGAAAGCACGTGGTCGACCTATGGGTGCTTCTAATGTTAGGAGCAAGAGCAGAAAGCTTGTGAGTCCGGAGCAGGTAGGAAACAACAGATCTAAAGAAAAACTAAACAAACCATCGATGGATATTAGCAGCTGGAAAGAGAAACAAAATGTGGATCAGGCTGTGACAACGTTCGGCTCATCTGAAATTGCTGGTGTGGTTGAGGATACACCACCTAAGGCAACCAAGAATCATAAAGGCATTCGCGGTCTGATGGAATGCGATAACGGGTCATCAGAAAGTATAAATCTTGCTATGAGTGGGTTGCAGCGTAGGAAATCTCGCAAGGTTCGTCTACTCAGTGAGTTGCTTGGTAATACAAAAACCAGTGGTGGTAGTAACATCAGAAAAGAAGAGTCTGCTTTGAAGAAGGAATCAGTTAGAGGTCGAAAAAGAAAGTTGTTACCTGAAAACAATTATGTCAGCCGGATATTGAGTACAATGGGTGCAACCTCTGAAAATGCTTCCAAAAGTTGTGACTCTGATCAAGGTAATAGTGAATCAACTGATAGTGGGTTTGACAGAACTCCATTTAAGGGTAAGCAGAGAAACAGAAGATTTCAGGTTGTTGACGAGTTTGTACCATCACTTCCTTGTGAAACTTCACAAGAAGGTATCAAGGAGCATGATGCAGATCCTAGTAAGAGATCAACTCCTGCGCACTCTTTATTCACTGGAAACGATTCTGTTCCTTGTCCTCCGGGTACTCAGAGAACAGAGAGGAAGCTCAGTTTACCCAAGAAGAAGACAAAGAAGCCTGTAATCGATAATGGGAAGAGCACTGTGATCAGTTTTAGTAACGGCATTGATGGAAGTCAAGTTAACTCGCATACTGGTCCTTCCATGAACACAGTATCCCAAACTCGAGACTTATTGAATGGGAAAAGGGTGGGCGGTTTATTTGACAACCGTTTGGCTTCAGATGGATATTTCAGAAAATATCTCTCTCAGGTTAATGATAAGCCGATAACATCTTTGCATTTGCAAGACAATGATTATGTGAGGTCAAGAGACGCGGAACCAAACTGTCTTCGAGATTTTAGTTCCTCTTCTAAATCCAGCTCAGGTGGATGGTTGAGAACTGGAGTAGATATTGTTGACTTCAGAAACAACAACCACAATACAAACAGATCGTCTTTCTCGAACTTGAAGCTAAGATACCCCCCTTCTTCTACTGAAGTTGCGGATTTATCTCGGGTGCTGCAAAAGGATGCTTCTGGTGCAGATAGAAAGGGGAAGACTGTTATGGTCCAAGAACATCATGGAGCACCAAGAAGCCAAAGTCACGATAGAAAGGAGACTACGACTGAAGAGCAAAACAACGATGATATTCCAATGGAGATAGTGGAGCTCATGGCCAAAAACCAGTACGAGAGGTGTCTTCCCGACAAAGAAGAAGATGTTAGCAACAAACAGCCATCACAAGAAACAGCACACAAATCCAAGAATGCTCTACTGATTGATCTCAATGAAACCTACGATAACGGGATCTCACTTGAGGACAACAACACATCAAGACCACCAAAACCGTGTAGTAGCAACGCAAGGAGGGAAGAACATTTTCCTATGGGAAGACAGCAGAACTCTCATGACTTCTTCCCAATAAGTCAGCCTTATGTGCCTTCTCCGTTTGGGATCTTTCCTCCTACCCAAGAAAACCGAGCCAGCTCCATCCGGTTTTCTGGTCACAACTGTCAGTGGCTTGGGAATTTGCCAACTGTGGGTAATCAGAACCCTTCTCCATCCTCATTTCGGGTATTACGTGCTTGTGATACTTGCCAGAGTGTTCCTAATCAATACAGAGAAGCTTCTCATCCAATTTGGCCATCTTCCATGATACCACCACAGAGTCAATACAAGCCAGTTTCTTTAAATATTAATCAGTCAACAAATCCGGGTACGCTTTCACAGGCATCTAACAATGAAAATACATGGAACCTCAACTTTGTTGCTGCCAACGGGAAGCAAAAATGTGGGCCTAATCCAGAATTTTCATTTGGCTGCAAACATGCTGCTGGGGTTAGTAGTAGTAGTAGTAGGCCAATAGATAACTTTTCTAGTGAGAGCTCTATACCGGCATTGCATCTACTCAGCCTTCTGGATCCTCGCCTGAGGTCAACGACTCCCGCTGACCAACACGGAAACACTAAATTTACTAAAAGACATTTTCCGCCAGCCAACCAGTCCAAAGAGTTTATAGAGCTTCAAACAGGGGACTCTAGTAAGTCAGCCTACTCAACTAAGCAGATACCTTTTGATCTATACAGCAAGAGATTCACACAAGAGCCTTCCCGGAAGAGTTTCCCCATCACTCCACCTATTGGGACGTCTTCACTTTCATTTCAAAATGCTTCATGGAGTCCTCATCATCAAGAGAAGAAAACCAAGAGAAAAGACACCTTTGCTCCTGTTTACAATACTCATGAAAAGCCGGTGTTTGCAAGCAGCAACGACCAAGCGAAGTTCCAGCTGCTGGGAGCATCGAATTCCATGATGCTTCCTTTGAAATTTCACATGACGGATAAAGAAAAGAAACAAAAGAGAAAAGCAGAGAGCTGCAATAACAATGCCTCTGCGGGACCTGTGAAGAACAGTTCTGGACCCATTGTGTGCAGCGTCAATAGAAACCCTGCTGATTTCACCATTCCTGAACCTGGGAATGTTTACATGTTAACGGGTGAACATCTGAAAGTCCGTAAACGCACAACCTTCAAGAAAAAGCCAGCCGTGTGTAAGCAGGACGCAATGAAGCAGACCAAGAAGCCGGTTTGTCCACCTACACAAAATGCCTAAAGATATACAATGTGTGTGGGAGGGATTTGTGCAGTTCATTGTGAAACAGATACTGAGGCAGAGGGATTAACAGATGGAGAGGGATACAAAGAGAGGGAGAGAGACAGAGACAGAGAAAGAGAAAGAGAGATCATTCCTATTGAAAACAAGAATAAGTCAGACAGGAAACATTAAAATGCAAATCTTCCTCATGTTCTTGGTCTCTGGTCTTAAAAACATATCTTTGCTTATGGTTTGTTCAAGCATACTTGGGAACCATTCAGCTTGTGTATATATTTAAATGACTGTAGTACCCCTGATAGGCCTTGTTGTTTTTTGTTTGTTTTTTTGGGAAATACTAGATACCTTTCAGCTGGCGTTATATATATATTTAGTCTTTATTT>gi|347015062|gb|JF806630.1| Pyracantha fortuneana TFL1-like protein (TFL1) gene, complete cdsCAACCATACAAGGATTCCACTCCCAAGCAATATAAGAAGTGCTATTAGTTCCTCCTGAATTGACTTATCCATTAATCTTTTCTTTTTACACTCTCTCTCTCTCTCCCTTAAAATGACAAGAGCCTCGGAGCCTCTGGTTGTTGGGAGAGTGATAGGAGATGTTCTTGATTCCTTCACTGCAACAACAAAAATGTCTGTCACTTACAACACCAAGCTAGTCTGCAATGGACTTGAGCTCTTTCCTTCTGTTGTCACAGCCAAACCTAGAGTTGAGATTCAAGGAGGGGATATGAGATGTTTCTTTACTTTGGTATATATAAATCGATCTGTTATTAATGAATTGAGTAGTTCTTGTTTGTATTTAACCATCATTATATTACTCCCTAACCCTTACTCCCCCTTATTGGCATATTAATTTGATGTTATTGTTTTGAAGTCTTGTGATAGTTTTCTTAATCTTGCAGGTGATGACAGGCCCAGATTTTCCTGGCCCTAGTGATCCTTATCTAAGGGAGCACCTGCACTGGTATACACCACCACTATGAATTTATTTATATTTTTTTTTGGTTACACATATGAAATAACTTAACCTAGCTTTAAAGTGGAAGGTTAACCTAGATACAAATCAATTTAATTTTTTCTATCGAAACAAATTAATTTGATTAAAAGACCAAATAAACATTATGGGCCGGAGATTTTACGGTATTTTATTGAAAAAAATAAAATATCGGTACATTTTAACATACACATGATGTTCAAAATTACACTACAAGGTTAGGTTCAAGTGAATAAAAAAAGAAAGATGTGATTATACTATAACAAGGTTGGTAGTTACATTGTGGACGTTCTATTACATTGTTAAGGTAGGTTTTTGTACTTGAACGTGATTGGATTACAAAATTAACGTTTATTATTATACCTATACATGTGTTATTACTACAAACATTATGAACTTACACAACATCATAATCGTGTTACCACATGACGTCAACATACAAGATCTAAGGTAAAGTTACATTGTAATTGTTCAAATTTACACTCCAAGGTCACATGATTTTCTTAATGTTACATTTAATTACATCAAATGACGTTGTGAACGTTAAATTACACTGTTAATGTAATATATTATAGTTGAACATTAATGCAATACAGTTAACGTTCAAATTAAATAACTAGTACTTTATTTTTTAATAAGGTATCATAGACGGACCTAAACATTACATTAATTAATTTCAGCATGCTATACATATTCTCATAAAGTACTATCATTTCCCAAAGCCCTATAAAGTACGTAGGCATTTTCATCATAAAGAAGATGAAGAAAAAGTGTAGGCATTTTCATCAAGAAGTAGAAGAAGAAAAACTGTCGACAATATTAGTGTCCTTCTGTACTCGTTAAGCATCAACCATAGTTACCAGCTGTAAAGAGCTATAAACATGCAAAGAAAAATTGTTGAGTACAAAACTAACAAAAATTACGACTGTAGTCCTTCTGTACTTGTTATACCTTTGCCGTAATTTTGTGCTCGTTTGATTTTTTTTTTTTCATACAAAACTAACAAAAATTTCTCAAATAACAGGATTGTGACAGACATTCCAGGCACCACAGATGCCACATTTGGTAAGTCCTACATATACAAGATATTAGCATTCATGGTGTTTGTTTCCCTTCATATACAAGATATTAGCATTCATGGTGTTTGTTTCCCTTTCTTTCAATAAGTTGGCTAATTTAGGGTTTAATTAATCGTATTAACAGGAAGAGAGGTGGTGAGTTACGAGATGCCGAGGCCCAACATTGGCATCCACAGGTTTGTGTTTGTTCTCTTCAAGCAGAATCGAAGACAATCAATCAACACACCTTCGTCGAGGGATCACTTCAGCACTCGAAGCTTCGCGGCTGAAAATGACCTGGGTCTTCCTGTCGCTGCCGTCTACTTCAGCGCGCAGAGAGAAACTGCAGCTAGAAGACGCTAGCTAGTAGCTCTACCCAGAACTCCTCCATCCATTATCCATATATATGTTAAATAAAGGCTTCTTTAGAGATAGGCCATTGTAACTCTTGTTTCCCGATAACCTTAATTTTAACTTGTTGACGTGTAAGAAAATAAGTAACCTGTTATTACAAATTATTTACAATGTATGCCACAATATCTTAATTATGTTAAAAAAAATTATTATTACCTAAAATAATTATGAATTTCGTTGTGTATTAATAGGCATGATTTCAGATTTTGTTTTTTCCCTCTGAATTTTTTATTTTTTATTTTTATTTTTTTTGAAAAAAAATGAAACAACTGGCGTGGCAAGCCATCCCTTTCGGGACGTTTTGGAACCAAAAAGACTATGAAAATTTTTATCCTACCCGTAACCACAGTCAAGCAACẢM ƠN THẦY VÀ CÁC ANH CHỊ ĐÃ CHÚ Ý LẮNG NGHE!