Giáo trình Trao đổi chất và năng lượng
MỤC LỤC
MỤC LỤC. - 1 -
CHƯƠNG I. KHÁI NIỆM VỀ TRAO ĐỔI CHẤT VÀ TRAO ĐỔI NĂNG LƯỢNG. - 3 -
I. NHỮNG KHÁI NIỆM CƠ BẢN CỦA NHIỆT ĐỘNG HỌC. - 3 -
1.Định luật thứ nhất của nhiệt động học. - 3 -
2. Định luật thứ hai của nhiệt động học. . - 4 -
II. BIẾN THIÊN NĂNG LƯỢNG TỰ DO CỦA CÁC PHẢN ỨNG HÓA HỌC. - 5 -
III. KHÁI NIỆM VỀ PHOSPHATE CAO NĂNG. . - 7 -
IV. Mối quan hệ giữa năng lượng tự do và entropy. . - 9 -
V. NHIỆT ĐỘNG HỌC CỦA HỆ THỐNG HỞ. - 9 -
CHƯƠNG II. OXY HÓA KHỬ SINH HỌC . - 13 -
I. KHÁI NIỆM CHUNG . - 13 -
II. BIẾN HÓA NĂNG LƯỢNG TRONG CÁC PHẢN ỨNG OXY HÓA KHỬ. . - 14 -
1. Phản ứng oxy-hóa - khử và thế khử tiêu chuẩn. - 14 -
2. Biến thiên năng lượng trong quá trình vận chuyển điện tử. - 16 -
CHƯƠNG 3. ENZYME OXY HÓA - KHỬ. - 17 -
I. DEHYDROGENASE PHỤ THUỘC PYRIDINE. - 18 -
II. Dehydrogenase phụ thuộc flavin. - 20 -
III. CYTOCHROME. . - 21 -
1. Cytochrome c. . - 22 -
2. Cytochrome oxydase. . - 23 -
3. Các phức hệ cytochrome b. . - 25 -
4. Cytochrome b5 . - 26 -
5. Cytochrome vi khuẩn và phosphoryl hóa oxy-hóa. . - 26 -
IV. SUPEROXIDE DISMUTASE, CATALASE VÀ PEROXYDASE. . - 27 -
1. Peroxide và superoxide. . - 27 -
2. Superoxide dismutase. - 27 -
3. Catalase và peroxydase. - 28 -
4. Oxygenase. - 28 -
5. Hydroxylase chứa molybden. . - 29 -
CHƯƠNG 4. TRAO ĐỔI CARBOHYDRATE TRONG QUÁ TRÌNH HÔ HẤP. - 31 -
I. SỰ TIẾP NHẬN VÀ HÌNH THÀNH GLUCOSE TRONG TẾ BÀO. - 31 -
1. Sự thâm nhập của glucose vào tế bào. . - 31 -
2. Phosphoryl-hóa glucose. Hexokinase và glucokinase. - 32 -
3. Dephosphryl-hóa glucose. Glucoso-6-phosphatase. . - 34 -
II. GLYCOLYS. . - 34 -
1. Glycolys là cơ sở của các quá trình lên men. . - 35 -
2. Các phản ứng của glycolys. - 36 -
3. Các phản ứng sau glycolys. . - 42 -
4. Các phản ứng lôi cuốn các loại carbohydrate khác vào quá trình glycolys. - 43 -
III. DECARBOXYL-HÓA OXY-HÓA ACID PYRUVIC VÀ CHU TRÌNH ACID
TRICARBOXYLIC. - 45 -
1. Decarboxyl-hóa oxy-hóa acid pyruvic. . - 45 -
2. Các phản ứng của chu trình acid tricarboxylic. - 47 -
IV. PHOSPHORYL HÓA OXY HÓA. . - 51 -
CHƯƠNG 5. TRAO ĐỔI CARBOHYDRATE TRONG QUÁ TRÌNH QUANG HỢP. - 55 -
I. KHÁI NIỆM VỀ QUANG HỢP . - 55 -
1. Các yếu tố ảnh hưởng đến quang hợp. - 56 -
2. Phân tử biến hóa năng lượng. - 58 -
II. Khái niệm về tích chất hai giai đoạn của quang hợp. - 59 -
1. pha sáng của quang hợp. - 60 -
2. Pha tối của quang hợp. - 66 -
III. Cơ sở cấu trúc của quang phosphoryl-hóa. . - 71 -
CHƯƠNG 6. TRAO ĐỔI LIPID TRUNG TÍNH . - 73 -
I. OXY-HÓA ACID BÉO. - 73 -
1. β-Oxy-hóa acid béo no có số nguyên tử carbon chẳn. . - 73 -
2. Oxy-hóa acid béo no có số nguyên tử carbon lẻ. . - 75 -
3. β-Oxy-hóa acid béo không no .87
4. Thể cetone. .89
5. Sử dụng lipid dự trữ cho mục đích sinh tổng hợp. Chu trình glyoxylate. .90
II. SINH TỔNG HỢP ACID BÉO.91
1. Sinh tổng hợp acid béo no. .91
2. Sinh tổng hợp acid béo không no. .93
III. SINH TỔNG HỢP TRIACYLGLYCERIN. .95
CHƯƠNG 7. MÀNG SINH HỌC VÀ SỰ VẬN CHUYỂN VẬT CHẤT QUA MÀNG .97
I. THÀNH PHẦN CẤU TẠO CỦA MÀNG TẾ BÀO. .97
II. CẤU TRÚC PHÂN TỬ CỦA MÀNG TẾ BÀO. .97
1. Màng lipid luôn chuyển động.97
2. Protein màng nằm xen qua màng và tạo khe trên màng.98
3. Sự lai ghép màng có mặt trong nhiều quá trình sinh học. .100
III. VẬN CHUYỂN CHẤT TAN QUA MÀNG. .100
1. Vận chuyển theo kiểu khuếch tán đơn giản .101
2. Vận chuyển tích cực qua màng. .103
kị nước nằm xen kẽ màng tạo ra khe cho phép glucose vận chuyển qua màng tăng khoảng 50.000 lần so với khi không có protein vận chuyển. Động học quá trình vận chuyển glucose qua màng giống hệt như động học quá trình xúc tác. (Hình 33). b/ Cl- và HCO3- đồng vận chuyển qua màng tế bào: Sự đồng vận chuyển Cl- và HCO3- qua màng hồng cầu xẩy ra trong quá trình hô hấp ở cơ thể động vật. Bình thường CO2 thải ra từ các mô trong quá trình hô hấp được thu vào hồng cầu và biến đổi thành bicarbonate (HCO3- ) tan trong huyết tương mạnh hơn nhiều so với CO2. Điều này cho phép huyết tương vận chuyển được nhiều hơn CO2 tới phổi. Ở phổi HCO3- lại quay trở lại hồng cầu và biến đổi về lại dạng khí CO2. Có nghĩa là để cho quá trình trao đổi khí xảy ra bình thường HCO3- phải vận chuyển qua màng hồng cầu rất nhanh. Trong thực tế nhờ protein vận chuyển, sự vận chuyển HCO3- qua màng hồng cầu được gia tăng hàng triệu lần. Hình 33. Thay đổi năng lượng tự do trong vận chuyển và khuếch tán qua màng khi có và không có protein vận chuyển Protein vận chuyển HCO3- cũng có 12 đoạn peptide xen kẽ xuyên màng tạo khe vận chuyển HCO3-. Trong khi protein vận chuyển glucose có hướng từ ngoài vào trong hồng cầu thì protein vận chuyển HCO3- lại hoạt động theo cả hai hướng. Trong thực tế quá trình vận chuyển HCO3- thường kèm theo sự vận chuyển Cl- theo hướng ngược lại. Hệ vận chuyển đơn chuyển một hướng gọi là uniport (như hệ vận chuyển glucose), còn hệ vận chuyển hai hướng gọi là cotransport có hai kiểu. Kiểu vận chuyển đồng hướng (đồng chuyển – symport) và kiểu ngược hướng (nghịch chuyển – antiport) như trường hợp vận chuyển HCO3- và Cl- qua màng hồng cầu (hình 34) 102 Trao đổi chất và năng lượng 103 Hình 34. Ba hệ vận chuyển khác nhau theo cơ chất và hướng vận chuyển của cơ chất. 2. Vận chuyển tích cực qua màng. Trong vận chuyển thụ động vật chất vận chuyển theo độ giảm dần gradient nồng độ và như vậy không xảy ra sự tích lũy vật chất. Ngược lại, vận chuyển vật chất tích cực thường ngược với gradient nồng độ và cho phép tích lũy vật chất. Do vậy theo quan điểm của nhiệt động học thì vận chuyển vật chất tích cực không xảy ra ngẫu nhiên mà phải kèm theo sự tiêu tốn năng lượng (ATP), hoặc được bù về mặt năng lượng bằng sự vận chuyển theo gradient nồng độ của một chất khác. Vận chuyển tích cực qua màng có ý nghĩa sinh học hết sức quan trọng. Sau đây là một số kiểu vận chuyển tích cực tiêu biểu nhất. a/ Đồng vận chuyển tích cực Na+ và K+. Ở bất kỳ tế bào động vật nào cũng có sự chêng lệch nồng độ Na+ và K+ bên trong và bên ngoài. Nồng độ Na+ bên trong bao giờ cũng thấp hơn bên ngoài. Sự phân bố không cân đối Na+ và K+ được duy trì nhờ hệ thống vận chuyển tích cực Na+ và K+ qua màng tế bào do enzyme Na+K+ ATPase xúc tác. Trong quá trình vận chuyển này enzyme nói trên thủy giải ATP cung cấp năng lượng để bơm đồng thời 3 ion Na+ ra ngoài và 2 ion K+ vào trong tế bào. Enzyme Na+K+ATPase nằm xen kẽ màng tế bào. Nó cấu tạo từ 2 tiểu đơn vị có MW tương ứng là 50.000 và 110.000 Da tạo khe khá rộng xuyên qua màng tế bào. Cơ chế hoạt động của nó như sau: Hệ enzyme vận chuyển Na+ và K+ hoạt động theo chu kỳ tương ứng với sự thay đổi cấu hình của enzyme. Trong đó cấu hình không gắn phosphate (cấu hình I) có ái lực cao đối với Na+ và gắn với 3 Na+ bên trong tế bào. Tiếp theo ATP gắn vào enzyme và xảy ra phản ứng gắn nhóm phosphate lên enzyme và chuyển enzyme sang cấu hình II có tính ái lực thấp đối với Na+, nhưng lại có ái lực cao đối với K+. Điều này cho phép nó giải phóng 3 Na+ ra môi trường bên ngoài và gắn với 2 K+ từ môi trường bên ngoài. Cuối cùng enzyme bị mất gốc phosphate và giảm ái lực đối với K+ và giải phóng nó vào bên trong tế bào (hình 35). Do sự phân bố không đồng đều Na+ và K+ nên hai bên màng tế bào bao giờ cũng có thế điện động xuyên màng cỡ khoảng từ –50 tới –70mV (bên trong âm so với bên ngoài). Theo tính toán khoảng 25% năng lượng của cơ thể thường xuyên phải tiêu tốn để duy trì hệ 103 Trao đổi chất và năng lượng 104 hệ Na+ K+ ATP hoạt động . Hạt cây bụi (cây shrub) ở Phi châu chứa ouabain là chất ức chế đặc hiệu đối với enzyme Na+ K+ ATPase và được thổ dân sử dụng để tẩm đầu tên. Do vậy nó có tên là ouabain từ tiếng địa phương waba yo, có nghĩa là tên thuốc độc. Hình 35. Sơ đồ vận chuyển Na+ và K+ qua màng. b/ Ba hệ vận chuyển ATPase. Trong thực tế người ta phân biệt 3 hệ vận chuyển Na+ K+ ATPase. Hệ vận chuyển P-ATPase. Hệ vận chuyển Na+ K+ ATPa được mô tả ở trên thuộc hệ vận chuyển có tên chung là hệ vận chuyển ATPase kiểu P (P-type ATPase).Tất cả có cấu tạo giống nhau và đều bị ức chế bởi ouabain. Kiểu vận chuyển này rất phổ biến ở thực vật bậc cao trong đó bơm H+ có nhiệm vụ bơm proton ra ngoài màng tạo chênh lệch khoảng 2 độ pH tương ứng với thế điện động xuyên màng khoảng 250mV. Để đẩy 1 proton ra ngoài phải tiêu tốn 1 ATP. Hệ vận chuyển ATPase kiểu V. (V-type ATPase): Chịu trách nhiệm bơm proton vào một số ngăn nội bào (intracellular compartement) như: không bào ở thực vật và nấm mốc, lysosome, endosome, bộ máy golgi và các bộ phận bài tiết khác ở tế bào động vật và làm 104 Trao đổi chất và năng lượng 105 cho pH ở đấy giảm so với pH tế bào chất bao bọc xung quanh. Hệ V-ATPase hoạt động khác so với P-ATPase ở chỗ không có sự gắn và nhả nhóm phosphate. Tuy nhiên, cơ chế hoạt động của nó còn chưa biết nhiều. Hệ vận chuyển ATPase kiểu (F-type ATPase) đóng vai trò trung tâm trong việc tạo năng lượng ATP ở vi khuẩn, ti thể và lục lạp. Gọi là hệ vận chuyển F-ATPase vì nó là yếu tố tạo năng lượng thông qua phản ứng tạo ATP từ ADP và Pi song hành với sự vận chuyển proton qua màng từ nồng độ cao xuống nồng độ thấp. Sự chênh lệch nồng độ H+ được tạo bởi năng lượng sinh ra trong quá trình hô hấp và puang hợp ở ti thể và lục lạp. Do vậy, F- type ATPase còn được gọi là hệ enzyme ATPase. Sự chênh lệch nồng độ hai bên màng cung cấp năng lượng cho quá trình vận chuyển tích cực ion thứ cấp. Sự chênh lệch nồng độ ion Na+ và H+ sinh ra trong tiến trình trao đổi chất nói chung chủ yếu nhờ năng lượng nhận được từ quang năng, từ quá trình oxy hóa, và phản ứng thủy phân ATP sẽ là động lực cho quá trình đồng vận chuyển tích cực các ion khác ngược với gradient nồng độ của chúng. Thí dụ, lactose được vận chuyển ngược với gradient nồng độ vào E. coli nhờ hệ vận chuyển có tên gọi là galactosidase permease cho phép duy trì nồng độ lactose ở bên trong E. coli cao hơn 200 lần so với bên ngoài. Điều này đạt được nhờ sự đồng vận chuyển lactose và H+ vào bên trong E. coli (hình 36). Hình 36. Sơ đồ hấp thu lactose Tương tự, ở màng ruột glucose và một số aminoacid cũng được hấp thu vào bên trong tế bào nhờ quá trình đồng vận chuyển Na+ theo chiều gradient nồng độ. Ở phần lớn tế bào động vật ion Ca2+ cũng được duy trì nhờ cơ chế đồng vận chuyển theo chiều ngược với Na+, 1 ion Ca2+ được bơm ra ngoài tế bào đồng thời với 3 ion Na+ được bơm vào trong tế bào. Sự đồng vận chuyển vật chất cùng hướng (hoặc ngược hướng) với sự vận chuyển Na+ từ bên ngoài vào tế bào được duy trì nhờ hệ Na+K+ATPase đóng vai trò chính trong nhiều quá trình vận chuyển vật chất xuyên màng. Do vai trò cực kỳ quan trọng của sự chênh lệch nồng độ ion hai bên màng nên bất kỳ yếu tố nào gây xáo động quá trình hình thành nó đều gây hại đối với cơ thể sống. 105 Trao đổi chất và năng lượng 106 Valinomycin và monensin là hai kháng sinh có bản chất là peptide vòng. Valinomycin vận chuyển K+, còn monensin vận chuyển Na+ xuyên màng theo chiều gradient nồng độ và làm mất sự chênh lệch nồng độ của chúng. Do đó chúng được gọi là chất chuyển ion (ionophore) và thể hiện hoạt tính kháng sinh thông qua việc làm mất chênh lệch nồng độ ion hai bên màng. Kiểu vận chuyển ion khác với hai kiểu trên là vận chuyển ion theo kênh (ion chanel) thường có mặt ở tế bào thần kinh, tế bào cơ và một số loại tế bào khác. Trong thực tế các tín hiệu kích thích lan truyền nhanh chóng trên tế bào thần kinh và tế bào cơ là nhờ sự thay đổi thế điện động của màng tế bào tạo bới các kênh vận chuyển ion. Kênh ion được nghiên cứu kỹ hơn cả là thụ thể acetylcholine trong tiếp diện (synapse) – nơi tiếp giáp của hai tế bào thần kinh. Tín hiệu thần kinh lan truyền tới synapse của tế bào neuron tiền synapse sẽ kích thích tiết acetylcholine. Chất này khuếch tán và gắn lên thụ thể nằm trên màng tế bào neuron hậu synapse và làm thay đổi cấu hình thụ thể dẫn đến sự mở kênh ion nằm trong màng. Điều này tạo điều kiện cho Na+ di chuyền theo gradient nồng độ từ synapse vào tế bào neron hậu synapse làm thay đổi điện tích của màng và làm xuất hiện tín hiệu thần kinh mới lan truyền tiếp tục. 106
File đính kèm:
- giao trinh trao doi chat va nang luog.pdf